Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) Unkhair memiliki tujuan untuk:
- Menyelenggarakan layanan pendidikan dan pengajaran yang profesional dan bermutu dengan menjunjung tinggi etika profesi yang berbasis pada nilai-nilai budaya lokal.
- Menghasilkan lulusan yang memiliki daya saing, berkarakter, berintegritas dengan memiliki kemampuan pedagogik, kepribadian, profesional dan sosial sehingga mampu berkompetisi secara global.
- Meningkatkan kualitas penelitian dan pengabdian kepada masyarakat sesuai dengan kebutuhan berbasis kepulauan dan kemajemukan yang berkelanjutan.
- Menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan riset untuk pengembangan pendidikandan pengajaran, sains, bahasa, seni, humaniora, dan teknologi yang berdaya saing tinggi dengan memanfaatkan potensi wilayah kepulauan untuk meningkatkan kesejahteraan masyarakat.